皇冠土木工程专业隶属于土木工程系，源自1944年成立的皇冠工学院土木水利系，经历新中国院系调整后于1986年复建恢复招生，2008年土木工程专业大类招生；2010年被评为教育部特色专业，2019年被评为首批国家一流本科专业。2018年整合土木工程、工程造价、给排水、建筑环境与能源应用工程为新土木工程，并于2019年起按照新土木工程专业进行招生。
专业以“通专融合、技管并重、基础前沿兼顾”为理念，重构宽口径、新内涵、模块化课程体系，包括专业基础与通识模块、专业主修模块、新技术拓展模块和学科交叉的项目制模块。新课程体系以模块化构建宽口径知识体系，以强基础满足相关专业指南要求，并应对专业口径拓宽；以行业需求牵引专业课程重构，并匹配工程教育认证理念；以新技术发展带动新课程建设，符合新时代大土木复杂工程需求。专业获批国家级一流本科课程2门、省部级一流课程6门；建成校级通识模块课程1门、全英文品牌课程2门。
本专业依托学科——土木工程学科，是皇冠西南资源环境与灾害防治“985工程”、创新平台“重大工程安全与灾害力学交叉学科中心”以及皇冠双一流建设学科“深地岩体力学与地下水利工程”的主要支撑学科。在长期服务国家、地方战略需求的过程中，多学科交叉融合，土木工程学科形成防灾减灾与重大工程安全保障、工业化建筑技术、工程结构新型材料性能及其应用、水环境与水资源处理、人居环境优化及新能源应用等多个特色学科方向。上海软科中国最好学科排名从2019年的24名上升到2023年的11名，进入全国前7%；2024年泰晤士高等教育中国学科评级为A+。专业拥有加拿大工程院院士、杰青、万人领军、千人计划学者及数十名优秀青年骨干教师。
专业与包括中建、中铁在内的行业知名企业，合作建立实习实践基地，结合丰富的学科科研平台、专业教学平台，给专业学生提供了学习与强化专业基础知识、锻炼和提升科研水平、丰富和拓展综合实践和创新能力的广泛机会，为毕业后的就业及继续深造打下良好的基础。专业学生继续深造攻读研究生（国内外）比例逐年提升，就业单位涵盖土木类企业（含设计、施工、监理、检测、管理等）、政府事业单位、非土木类企业。
